MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Blaberus giganteus) plasmid pBGIBA

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017925	CAT	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907364
2	NC_017925	AGC	2	6	828	833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387907364
3	NC_017925	ATT	3	9	868	876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907364
4	NC_017925	GAAA	2	8	886	893	75 %	0 %	25 %	0 %	387907364
5	NC_017925	AAT	2	6	994	999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907364
6	NC_017925	GAG	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387907364
7	NC_017925	ATA	2	6	1102	1107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907364
8	NC_017925	A	6	6	1143	1148	100 %	0 %	0 %	0 %	387907364
9	NC_017925	AAAT	2	8	1150	1157	75 %	25 %	0 %	0 %	387907364
10	NC_017925	AT	3	6	1204	1209	50 %	50 %	0 %	0 %	387907365
11	NC_017925	TA	3	6	1211	1216	50 %	50 %	0 %	0 %	387907365
12	NC_017925	T	6	6	1288	1293	0 %	100 %	0 %	0 %	387907365
13	NC_017925	AGA	2	6	1313	1318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387907365
14	NC_017925	AT	3	6	1326	1331	50 %	50 %	0 %	0 %	387907365
15	NC_017925	CTT	2	6	1339	1344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907365
16	NC_017925	T	10	10	1356	1365	0 %	100 %	0 %	0 %	387907365
17	NC_017925	T	6	6	1383	1388	0 %	100 %	0 %	0 %	387907365
18	NC_017925	AT	3	6	1389	1394	50 %	50 %	0 %	0 %	387907365
19	NC_017925	TAT	3	9	1409	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907365
20	NC_017925	CAGAAA	2	12	1423	1434	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387907365
21	NC_017925	T	9	9	1447	1455	0 %	100 %	0 %	0 %	387907365
22	NC_017925	AAT	2	6	1483	1488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907365
23	NC_017925	ATT	2	6	1505	1510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907365
24	NC_017925	T	8	8	1563	1570	0 %	100 %	0 %	0 %	387907365
25	NC_017925	A	6	6	1572	1577	100 %	0 %	0 %	0 %	387907365
26	NC_017925	CATT	2	8	1587	1594	25 %	50 %	0 %	25 %	387907365
27	NC_017925	CAT	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907365
28	NC_017925	T	8	8	1651	1658	0 %	100 %	0 %	0 %	387907366
29	NC_017925	TA	3	6	1670	1675	50 %	50 %	0 %	0 %	387907366
30	NC_017925	AACA	2	8	1699	1706	75 %	0 %	0 %	25 %	387907366
31	NC_017925	AT	3	6	1732	1737	50 %	50 %	0 %	0 %	387907366
32	NC_017925	TAT	2	6	1739	1744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907366
33	NC_017925	ATTT	2	8	1765	1772	25 %	75 %	0 %	0 %	387907366
34	NC_017925	T	7	7	1811	1817	0 %	100 %	0 %	0 %	387907366
35	NC_017925	AT	3	6	1831	1836	50 %	50 %	0 %	0 %	387907366
36	NC_017925	TCA	2	6	1858	1863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907366
37	NC_017925	TTC	2	6	1891	1896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907366
38	NC_017925	A	6	6	1921	1926	100 %	0 %	0 %	0 %	387907366
39	NC_017925	AAT	2	6	1948	1953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907366
40	NC_017925	GTT	2	6	1975	1980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907366
41	NC_017925	TTTTC	2	10	2012	2021	0 %	80 %	0 %	20 %	387907366
42	NC_017925	ATC	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907367
43	NC_017925	TCTT	2	8	2094	2101	0 %	75 %	0 %	25 %	387907367
44	NC_017925	T	9	9	2125	2133	0 %	100 %	0 %	0 %	387907367
45	NC_017925	T	7	7	2143	2149	0 %	100 %	0 %	0 %	387907367
46	NC_017925	ATC	2	6	2150	2155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907367
47	NC_017925	CAAAA	2	10	2156	2165	80 %	0 %	0 %	20 %	387907367
48	NC_017925	A	7	7	2219	2225	100 %	0 %	0 %	0 %	387907367
49	NC_017925	TA	3	6	2252	2257	50 %	50 %	0 %	0 %	387907367
50	NC_017925	TTC	2	6	2363	2368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907367
51	NC_017925	TC	3	6	2367	2372	0 %	50 %	0 %	50 %	387907367
52	NC_017925	AATAAA	2	12	2411	2422	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387907367
53	NC_017925	T	6	6	2427	2432	0 %	100 %	0 %	0 %	387907367
54	NC_017925	TCCAT	2	10	2442	2451	20 %	40 %	0 %	40 %	387907367
55	NC_017925	AATA	2	8	2452	2459	75 %	25 %	0 %	0 %	387907367
56	NC_017925	T	6	6	2475	2480	0 %	100 %	0 %	0 %	387907367
57	NC_017925	CAT	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907367
58	NC_017925	TTC	2	6	2492	2497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907367
59	NC_017925	A	6	6	2557	2562	100 %	0 %	0 %	0 %	387907367
60	NC_017925	TTG	2	6	2567	2572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907367
61	NC_017925	AAT	2	6	2610	2615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907367
62	NC_017925	AGA	2	6	2624	2629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387907367
63	NC_017925	CTG	2	6	2647	2652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907367
64	NC_017925	CAG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387907367
65	NC_017925	TAT	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907367
66	NC_017925	TCT	2	6	2760	2765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907367
67	NC_017925	A	6	6	2766	2771	100 %	0 %	0 %	0 %	387907367
68	NC_017925	AATAAG	2	12	2806	2817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387907367
69	NC_017925	CAT	2	6	2858	2863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907367
70	NC_017925	AAT	2	6	2908	2913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907367
71	NC_017925	AT	3	6	2950	2955	50 %	50 %	0 %	0 %	387907367
72	NC_017925	TTG	2	6	3050	3055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907367

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.